連續(xù)流閃速化學(xué)用于瑞德西韋合成中的C-糖基化反應(yīng)
新冠大流行截止2021年1月1號已導(dǎo)致全球超過9400萬例病例和200萬例死亡。在尋找有效藥中,由Gilead Sciences研發(fā)的瑞德西韋是美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)和歐洲藥品管理局(EMA)批準的第一種藥物。
據(jù)報道,僅在2020年第3季度,該藥的銷售量為8.73億美元。迫于全球的形勢,大幅提高該藥的產(chǎn)量才能滿足全球需求。瑞德西韋的生產(chǎn)工藝非常復(fù)雜,據(jù)報道,考慮到原材料的采購,首批產(chǎn)品需要9個月以上才能完成。而連續(xù)加工在簡化工藝中可起著至關(guān)重要的作用。實際上,在這條路線中的某些步驟中,已經(jīng)在工廠級生產(chǎn)規(guī)模使用了連續(xù)流技術(shù)。
在安全性,非對映選擇性,過程控制和時空產(chǎn)量方面提供了改進??梢灶A(yù)見,通過將其他合成步驟也轉(zhuǎn)換為連續(xù)流模式,這些優(yōu)點將得到補充,而其他優(yōu)點也將得以實現(xiàn)。
該藥物的合成路線如圖1所示,該路線始于鹵化吡咯并嗪胺1 / 1a與芐基保護的D-核糖-1,4-內(nèi)酯2 發(fā)生有機金屬介導(dǎo)的C-糖基化,以提供關(guān)鍵中間體3。然后再需要五步來提供API 瑞德西韋。已有文獻報道在室溫下連續(xù)流中進行的Grignard反應(yīng),其停留時間少于一分鐘。在沒有添加劑的情況下,以47%收率得到了產(chǎn)品。
圖1 瑞德西韋的合成路線
而另一方面,基于有機鋰的反應(yīng)可以使用價格更便宜且質(zhì)量更高的雜芳基溴化物1代替其碘化物類似物作為有機金屬前體。
有文獻報道使用1,2-雙(氯二甲基硅基)乙烷(BCDSE)作為雙齒硅基保護基,在N,N-二異丙基胺的存在下與有機鋰試劑反應(yīng),盡管反應(yīng)溫度低(-78°C)且反應(yīng)時間長,但該方法迄今為止提供了最高的收率(74%)。
實際上,與較溫和的格氏試劑相比,微反應(yīng)器和連續(xù)處理技術(shù)更適用于處理有機鋰試劑,因為可以極大程度的改善后者的傳質(zhì)和傳熱。
閃速化學(xué)(flash chemistry)領(lǐng)域擅長于處理流動中異常快速的反應(yīng)(反應(yīng)過程最多幾秒鐘),并已在許多情況下得到證明,可以實現(xiàn)原本不可能或不切實際的化學(xué)反應(yīng)。
特別令人感興趣的是閃速化學(xué)的可擴展方式,這種方式可以規(guī)避在藥物制造開發(fā)過程中面臨的的規(guī)模擴大問題。而連續(xù)流化學(xué)可以同時減輕在合成過程開始時因這一具有挑戰(zhàn)性的轉(zhuǎn)變而給供應(yīng)鏈造成的負擔。
Graz大學(xué)的Kappe等人描述了通過閃速化學(xué)發(fā)展連續(xù)流的方法,使用7-溴吡咯烷-嗪胺1作為有機鋰前體閃速合成糖基化吡咯烷嗪胺3。通過應(yīng)用微反應(yīng)器技術(shù),工藝溫度可以從-78℃顯著提高到-30℃。
此外,整個轉(zhuǎn)化過程的反應(yīng)時間可以大大減少到僅8 s。該結(jié)果最近發(fā)表在Org. Process Res. Dev. 期刊上(https://dx.doi.org/10.1021/acs.oprd.1c00024)。
實驗方案
1. C-糖基化釜式反應(yīng)研究
7-溴吡咯并三嗪胺1與2,3,5-三-O-芐基-D-核糖內(nèi)酯2的C-糖基化反應(yīng)包括三個步驟。在第一步,伯胺1被硅基保護基團(例如BCDSE)保護,釋放出2當量HCl,并在第二步被有機鋰堿中和。需要第三當量的有機堿才能執(zhí)行Li-Br交換并獲得雜芳基鋰1-Li。最后,對內(nèi)酯2的親核進攻產(chǎn)生所需的糖基化吡咯并三嗪3。
最初,為了檢查該工藝轉(zhuǎn)換為連續(xù)流的潛在問題,作者首先開始了釜式反應(yīng)研究。首先,原料1在已經(jīng)報道的0.2 M反應(yīng)濃度下是混懸液,因此必須將濃度減半以確保原料1的溶解度。
另一個重要的問題是加入BCDSE后會形成固體,這可能會導(dǎo)致流動反應(yīng)器內(nèi)發(fā)生堵塞。先前對固體進行的表征表明,該沉淀并不是受保護的胺,因為在0 ppm左右沒有信號(因為1H NMR光譜中該信號對應(yīng)SiCH3)。
作者認為該沉淀物是雜環(huán)1的質(zhì)子化形式,當1被質(zhì)子化后,上保護基反應(yīng)不能發(fā)生。在環(huán)境溫度下觀察到固體形成需要約5 s,因此必須要在很短的時間內(nèi)引入堿用以清除HCl。不過,在流動裝置中可以很容易地實現(xiàn)并控制這種短的停留時間。
在釜式反應(yīng)中,作者發(fā)現(xiàn)緩慢添加n-BuLi可獲得良好收率。假定副反應(yīng)由于傳熱不良,導(dǎo)致容器中出現(xiàn)局部熱點,傳質(zhì)不良,進而導(dǎo)致局部化學(xué)計量失衡。
這兩種作用都可能導(dǎo)致鋰化中間體的分解,并隨著反應(yīng)規(guī)模的增加而放大。但是,在連續(xù)流中進行反應(yīng)會增強傳熱和傳質(zhì),因此有望以可擴展的方式進行有效的反應(yīng)。
雜芳基鋰1-Li對內(nèi)酯的親核加成是面臨另一個關(guān)鍵挑戰(zhàn)。過去的研究表明內(nèi)酯的α質(zhì)子可被有機金屬試劑迅速去質(zhì)子化,導(dǎo)致鋰化雜環(huán)1-Li猝滅。已經(jīng)證明,當使用格氏試劑時,路易斯酸添加劑可以促進親核進攻。
然而,不溶性和稀有金屬物質(zhì)(NdCl3和四丁基氯化銨)增加了該工藝的成本和復(fù)雜性。有機鋰物質(zhì)由于其具有較高親核性,因此比格氏試劑具有更高的親核加成選擇性。在先前開發(fā)的格氏試劑的工藝中,作者已經(jīng)觀察到核糖內(nèi)酯加成物的開鏈中間體受到親核攻擊而產(chǎn)生的副產(chǎn)物。
而有趣的是,使用有機鋰方法時,作者并未觀察到上述的副反應(yīng)。這可能是由于雜芳基鋰1-Li的親核性增強,促進與內(nèi)酯2的快速反應(yīng),而不是與親電子性較高的酮中間體發(fā)生優(yōu)先反應(yīng),或者可能是由于Mg抗衡離子可以使溶液中存在較高比例的開鏈酮形式。
為了了解去質(zhì)子化相對于Li-Br交換的相對速率,作者進行了釜式實驗,其中一次添加了1當量n-BuLi。出人意料的是,在加入1當量正丁基鋰后,已經(jīng)交換了34%的溴化物,
加入2當量后,交換了62%。這意味著在這些條件下,兩個反應(yīng)的速率沒有顯著差異。
但是,為了避免形成的雜芳基鋰發(fā)生內(nèi)部淬滅,作者認為應(yīng)將去質(zhì)子化和Li-Br交換這兩個過程分步進行。由于已知n-BuLi在去質(zhì)子的同時可以快速進行Li-Br交換,作者試圖先使用N,N-二異丙基氨基鋰(LDA)去質(zhì)子,而LDA可以避免在該階段時就發(fā)生Li-Br交換,而繼續(xù)反應(yīng)一段時間后再加入n-BuLi來解決上述問題。
2. 初始連續(xù)流過程
根據(jù)上述這些觀察結(jié)果,作者設(shè)計了一種連續(xù)流裝置(圖2),確保在添加LDA(防止形成鹽)之前保證雜環(huán)1和BCDSE的反應(yīng)時間,然后再添加n-BuLi(以實現(xiàn)鋰-溴交換)。
作者選擇了連續(xù)流微反應(yīng)器Ehrfeld,F(xiàn)lowPlate,Hastelloy C-22 /sapphire ,該反應(yīng)器配備有小體積的混合板(TG混合器,內(nèi)部容積為350μL,通道寬度為0.2-0.5 mm)。這有助于在可放大的系統(tǒng)中進行快速混合和有效的傳熱。
圖2初步的連續(xù)流結(jié)果
將雜環(huán)1(THF中0.1 M)與BCDSE(THF中1.0 M)混合,通過在101μL反應(yīng)器體積后與LDA(THF /己烷中1.0 M)相結(jié)合,成功實現(xiàn)了微反應(yīng)器中的操作。然后,引入n-BuLi(己烷中1.6 M)形成雜芳基鋰1-Li,將其用內(nèi)酯2淬滅,得到所需的糖基化吡咯烷嗪胺3。
在第一次嘗試中,作者實現(xiàn)了54%的測定產(chǎn)率,同時包含21%的質(zhì)子化雜環(huán)副產(chǎn)物1-H。盡管未觀察到固體形成,但雜芳基溴1的溶解度遠低于其碘化物類似物1a,因此必須使其濃度低至0.1M。
然后進行流動實驗以研究該設(shè)置中的反應(yīng)速率。當所有流速乘以1.5(總停留時間= 5.3 s),反應(yīng)收率不變,這意味著這些停留時間都足以使得每個步驟中能夠完全反應(yīng)。相反,將流率減半(總停留時間= 16 s)導(dǎo)致產(chǎn)品3的收率差很多(31%)。這意味著在低流量下較差的混合和傳熱會嚴重影響實驗的效果。
與內(nèi)酯化步驟相比,內(nèi)酯2上雜芳基鋰1-Li的親核加成預(yù)期進行得較慢,進而作者對停留時間的更詳細研究。引入內(nèi)酯2后,安裝了毛細管反應(yīng)器,可提供額外的38 s停留時間。 當將毛細管反應(yīng)器升溫到-40或-20°C時,反應(yīng)的產(chǎn)率與先前的結(jié)果一致,這表明親核加成反應(yīng)在微反應(yīng)器板的最初5.3 s內(nèi)已經(jīng)完成。因此,額外的毛細管反應(yīng)器被證明是不必要的(圖2,條目4和5)。
在連續(xù)流中,提高耐熱性是改進有機鋰反應(yīng)的關(guān)鍵。雖然在釜式中糖基化過程需低溫(-78°C),但在-50至-30°C之間的連續(xù)流裝置中也得到了基本一致的結(jié)果(54-56%的收率)(圖2,條目6和7)。進一步施加-20°C的高溫會使產(chǎn)率降低到50%(條目8),因此選擇了-30°C的最佳反應(yīng)溫度用于進一步的實驗。
3. 連續(xù)流工藝的進一步優(yōu)化
如作者最初的實驗所示(圖2),LDA充當強堿,可保持溴化物的穩(wěn)定性(圖3a)。因此,將LDA用于脫質(zhì)子化,然后進行n-BuLi進行Li-Br交換被發(fā)現(xiàn)是最合適的組合。LDA篩選的化學(xué)計量在1到2當量之間(圖3b)。增加LDA的量增加了產(chǎn)物3的產(chǎn)率,同時減少了質(zhì)子化1-H的量。
圖3 雜芳基鋰的內(nèi)部淬滅及其通過改變LDA化學(xué)計量進行預(yù)防(a)由于快速的Li-Br交換而引起的內(nèi)部淬滅至1-H的機理。(b)采用不同的LDA化學(xué)計量比。嘗試改變?nèi)ベ|(zhì)子化和鋰-鹵素交換步驟的實驗結(jié)果
作者發(fā)現(xiàn)在糖基化過程中,形成的其他主要副產(chǎn)物是鋰化雜環(huán)1-Li對硅基保護基團的親核攻擊所致(圖4a)。中間體5繼續(xù)與有機鋰反應(yīng),或在淬滅/ HPLC分析期間簡單地水解,形成副產(chǎn)物6-8。作者認為,N-Si鍵(與C-Si鍵不同)在水的存在下是不穩(wěn)定的,因此也可能存在其他無法檢測到的中間物種。
圖4雜芳基鋰與硅基氯的副反應(yīng)(a)作者觀察到的雜芳基鋰與BCDSE反應(yīng)產(chǎn)生的副產(chǎn)物,根據(jù)LCMS分析提出了結(jié)構(gòu)。(b)篩選BCDSE化學(xué)計量以最大程度減少副產(chǎn)物6-8形成
這些副產(chǎn)物的存在暗示了BCDSE保護基可能存在不完全消耗的問題。為了解決這個問題,作者將BCDSE的化學(xué)計量從1.0當量逐漸降低到0.5當量(圖4b)。
出人意料的是,總收率未受到明顯影響,并且硅基的副產(chǎn)物的數(shù)量減少。為了便于純化(消除硅基的副產(chǎn)物)和降低成本,作者決定使用0.6當量進行操作。
由于即使使用亞化學(xué)計量的BCDSE也可以實現(xiàn)穩(wěn)定的流動過程,因此作者在不存在任何保護基的情況下,分批和流動地進行了實驗。使人驚訝的是,釜式反應(yīng)的產(chǎn)率為20%,流動化反應(yīng)的產(chǎn)率為49%。
不幸的是,在沒有硅基保護基的情況下,1與n-BuLi的反應(yīng)幾乎立即形成了固體,這使得該流動過程不可能長時間運行。
4. 過程穩(wěn)定性實驗
在對反應(yīng)參數(shù)進行其他精細調(diào)整之后,作者已經(jīng)開發(fā)出產(chǎn)品達到60%分離收率的反應(yīng)條件,總停留時間僅為8 s(圖5a)。為了證明該過程在更長的處理時間內(nèi)的穩(wěn)定性,作者進行了2小時的長時間運行,每5分鐘進行一次采樣(圖5b)。
實驗結(jié)果表明該過程是非常穩(wěn)定,在整個操作期間,產(chǎn)率僅變化<2%。在該實驗過程中,系統(tǒng)的壓降略有增加,從1.5巴增加到2.9巴??赡茉蚴求w系中逐漸產(chǎn)生了固體(例如,由痕量水產(chǎn)生的LiOH),但結(jié)果表明收率不會受到影響,并且在進行較大規(guī)模的實驗時可能更易于管理。
圖5優(yōu)化的反應(yīng)條件和長期穩(wěn)定性的連續(xù)流裝置的示意圖(a)EhrfeldFlowPlate(TG混合器)的示意圖以及反應(yīng)條件。(b)長期運行期間隨時間變化的反應(yīng)的結(jié)果
收集反應(yīng)產(chǎn)物,得到16.9g(收率60%,純度96%)糖基化產(chǎn)物3。在這種情況下,該材料已通過柱色譜法純化,但在放大規(guī)模中可以使用現(xiàn)有的結(jié)晶方法。這相當于8.5 g/h的通量,以及極高的時空產(chǎn)率10.4 kg L-1 h-1。高時空產(chǎn)率清楚地表明了采用閃速化學(xué)方法進行這些轉(zhuǎn)化的優(yōu)勢,即使在小型反應(yīng)器中,較短的反應(yīng)時間也可以實現(xiàn)高通量。當與放大規(guī)模反應(yīng)相結(jié)合時,將這種成熟的反應(yīng)連續(xù)流平臺升級到更大的版本,可節(jié)省大量的成本,時間和能源。
與報道的使用NdCl3和TBACl添加劑的格氏試劑的間歇方法相比,該方法的優(yōu)點在于所需添加劑的成本較低。雖然BCDSE是一個比較奇特的硅基保護基,但對每摩爾1a的加工成本僅為179歐元。與之相對的是,所報告的釜式工藝中每摩爾1a的加工成本為2091歐元。當然,必須指出的是,這些價格并不代表制造規(guī)模下的結(jié)果,但是隨著對無水NdCl3的需求的增多可能會增加大量成本。
實驗結(jié)論
作者探討了基于有機鋰的C-糖基化連續(xù)流合成瑞德西韋的工藝,通過仔細分析反應(yīng)混合物和添加順序,可以避免在微反應(yīng)器內(nèi)形成固體。又通過對反應(yīng)參數(shù)的優(yōu)化,包括硅基保護基和有機金屬試劑的篩選,使得轉(zhuǎn)化中副產(chǎn)物的含量降至最低。
作者通過精確調(diào)整工藝參數(shù),再加上微反應(yīng)器中賦予的優(yōu)異的傳熱和傳質(zhì)能力,可在僅8 s的總停留時間內(nèi)進行高度放熱的C-糖基化反應(yīng)。與釜式反應(yīng)所需的?78°C相比,連續(xù)工藝在?30°C的更高的過程溫度下,該反應(yīng)得以成功實現(xiàn),這將節(jié)省大量能源。
已建立并開發(fā)的連續(xù)流可擴展的反應(yīng)器系統(tǒng),具有實現(xiàn)更有效地生產(chǎn)關(guān)鍵糖基化中間體和相應(yīng)API的潛力。
原文:Flash Chemistry Approach to Organometallic C?Glycosylation for the Synthesis of Remdesivir, 2020, Org. Process Res.
Dev(https://dx.doi.org/10.1021/acs.oprd.1c00024)
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